大黄鱼（Larimichthys crocea）作为我国重要的经济鱼类之一，其种群健康状况和资源可持续利用问题一直备受关注。为了深入了解这一物种的生态适应性及遗传背景，本研究以大黄鱼为研究对象，采用分子标记技术对其遗传多样性和种群遗传结构进行了系统分析。
研究首先收集了来自不同地理区域的大黄鱼样本，并提取高质量基因组DNA用于后续实验。通过高通量测序平台获取全基因组SNP数据后，利用生物信息学工具对数据进行质量控制、比对以及变异检测等预处理步骤。接着，基于主成分分析（PCA）、群体结构分析（Structure）等方法评估了各采样点间个体间的亲缘关系及分类情况；同时计算了期望杂合度（Hexp）、观测杂合度（Hobs）等多项参数来量化总体及各子群内的遗传多样性水平。
此外，还构建了NJ树以展示进化分支模式，并结合Fst值进一步探讨了地理隔离对种群分化的影响程度。结果显示，在所考察范围内，大黄鱼存在显著的地理差异性，这可能与其栖息环境变化密切相关。但值得注意的是，尽管存在一定的空间分异现象，整体上仍保持较高的遗传连通性，表明该物种在自然条件下具备较强的扩散能力。
综上所述，本研究不仅揭示了大黄鱼种群内部复杂的遗传格局，也为今后制定合理的保护策略提供了科学依据。未来还需扩大样本规模并增加时间维度上的监测频率，以便更全面地理解其长期演化历程及其对气候变化响应机制。
