在一座宁静的小镇上，有一个看似普通的少年——工藤新一。他是一名高中生侦探，以敏锐的观察力和缜密的逻辑推理闻名。然而，在一次追查案件的过程中，他不幸被神秘组织灌下毒药，身体竟意外缩小成了小学生模样。为了隐藏身份，他化名为江户川柯南，寄宿在青梅竹马毛利兰家中。
每天，柯南不仅要面对自己的真实身份可能暴露的风险，还要协助糊涂侦探毛利小五郎解决各种离奇案件。凭借变声器、滑板等工具以及对案件细节的精准分析，柯南屡次揭开真相，拯救危局。而围绕在他身边的，还有聪明可爱的伙伴——阿笠博士、少年侦探团成员们，以及对他暗藏情愫的兰。
与此同时，那个改变他命运的神秘组织始终潜伏在暗处，他们的目的究竟为何？柯南能否恢复原貌并揭露组织的秘密？这一切都等待着答案揭晓……
